Persona 5 được P-Studio phát triển trong suốt 5 năm, một xưởng sản xuất game tại Atlus, xưởng này có vai trò đảm nhận toàn bộ sê-ri Persona.[9] Việc phát triển được chuẩn bị vào năm 2008, cùng thời điểm phát hành Persona 4, và cuối cùng tiến hành vào phát triển vào năm 2011 cùng thời gian phát hành Catherine.[10][11] Người chỉ đạo phát triển là Hashino Katsura, cho biết Persona 5 sẽ là game cuối cùng ông phát triển với tư cách là người dẫn đầu của P-Studio sau khi ông rời xưởng và tự lập một xưởng mới tên là Team Zero để tập trung vào dự án khác.[12][13] Ban đầu chỉ có 40 người tham gia sản xuất, con số này tiếp tục tăng lên 70, trong đó bao gồm người chỉ đạo khâu thiết kế là Maeda Naoya. Quá trình phát triển là một thử thách lớn với nhóm, dẫn đến nhiều thay đổi khác nhau và do phải đổi mặt với vấn đề phần cứng.[14]